初めて投稿します。
ここのサイトに載っていた改造コードを使い、第２次スーパーロボット大戦αを
進めていたのですが、ある日、突然クリアできなくなりました。
敵を全滅させてもクリアできなくなってしまったのです。
クリアできない時に熟練度取得条件を見ると？？？となっているのです。
でも、クリアできるシナリオもあります。
これって私のソフトが行けないのでしょうか？
誰か教えてください。

よく言われている不具合ですね。
どの改造コードを使っているか明記しないと回答がしにくいんですよ。
でも、今回はわかりますよ。ズバリ、強化パーツ関連のコードですね？あたりでしょう？
全強化パーツ９９個や９個はコードを入れたままにしていると、勝敗条件や熟練度条件が変更される時の処理に
失敗するらしく、先に進めないという現象が【様々】な掲示板で【多々】報告されています。
･･･コホン。つまり、全パーツ９９個にしたら一回セーブし、足りなくなったらまた入れて始めればＯＫって事です。
ちなみに、進めなくなったマップは、コードを切ってインターミッションからやり直してください。
そうしないと先に進めませんから。

Bobさん、ありがとうございました。
ちなみにいれたコードは
資金最大
強化パーツＡＬＬ９個
一回の撃墜で撃墜数999＆ＰＰ獲得で9999
ガガガハロ
パイロット養成に追加特殊技能
でした。
ちょっと多すぎましたね。
今度から強化パーツ関連のコードは外そうと思います。